Las guías de práctica clínica (GPC) son consideradas como buenos instrumentos para mejorar la práctica clínica. Sin embargo, todavía presentan numerosos inconvenientes. Por ejemplo, el dinamismo del avance tecnológico puede hacerlas obsoletas de forma rápida, o las distintas circunstancias locales pueden hacer que en un centro pueda ser aplicable una recomendación y en otro no.

Por ello, se necesita un enfoque metodológico en el desarrollo, difusión, y evaluación de las GPCs que permita fácilmente la introducción de nueva evidencia científica y la flexibilidad de adaptación local.

TAISS desarrolla GPC's basadas en la mejor evidencia científica disponible, y donde no existe o es contradictoria, utiliza el juicio colectivo de un panel de expertos manejado científicamente.

TAISS ha desarrollado GUIPCAR (Guía de Práctica Clínica para el manejo de la Artritis Reumatoide), la primera GPC española admitida por National Guideline Clearinghousee de la Agency for Health Policy and Research de los Estados Unidos.
En 2007 TAISS ha realizado la coordinación y la edición de la actualización de la guía GUIPCAR, iniciativa de la Sociedad Española de Reumatología (SER). La guía GUIPCAR 2007 está disponible en los siguientes documentos: Guía GUIPCAR 2007 Completa, Guía rápida GUIPCAR 2007, Recomendaciones GUIPCAR 2007, Colaboradores GUIPCAR 2007.

TAISS ha realizado el apoyo metodológico, la búsqueda bibliográfica y el diseño en internet de la Guía EPOC 2007, Guía de Práctica Clínica de Diagnóstico y Tratamiento de la Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica, iniciativa de la Sociedad Española de Neumología y Cirugía Torácica (SEPAR) y la Asociación Latinoamericana del Tórax (ALAT-ULASTER).

Con el enfoque adoptado en esta línea de investigación, TAISS desarrolla GPCs de tal manera que puedan estar permanentemente actualizadas según se produzcan nuevas evidencias científicas, adaptándolas a las características específicas de la organización y a las preferencias de los pacientes.